但是，大中型沼气工程与沼气发电工程的一次性投资费用都相当大，而沼气工程投资费用是沼气发电工程的4倍左右。只有在推广沼气工程应用的同时，不断进行研究提高沼池产气率，并积极推广应用沼气发电工程，才能在社会效益尽量保持不变的前提下，使经济效益不断提高，也才能使整个工程总的一次性投资回报率大大提高。
此外，沼气发动机发电与发动机余热利用综合热效率比任何其他热动力设备或装置的热效率都高。进行沼气发电即使民用，也可以将电通过电缆输送到每家每户，提前实现全部家用设备电气化，既方便又干净。用不完的电还可以并入电网中，这是科学、合理、应用沼气能源的途径。
6搅拌
静态发酵沼气池原料加水混合与接种物一起投进沼气池后，按其比重和自然沉降规律，从上到下将明显的逐步分成浮渣层、清液层、活性层和沉渣层。这样的分层分布，对微生物以及产气是很不利的。导致原料和微生物分布不均，大量的微生物集聚在底层活动，因为此处接种污泥多，厌氧条件好，但原料缺乏，尤其是用富碳的秸秆做原料时，容易漂浮到料液表层不易被微生物吸收和分解，同时形成的密实结壳，不利于沼气的释放。为了改变这种不利状况，就需要采取搅拌措施，变静念发酵为动念发酵。单化粪池发展到高速消化器。1967年布赖恩特分离纯化了沼气发酵微生物中的产气、产菌和产菌，人们对沼气发酵的微生物学原理开始有了正确的认识。1969年，厌氧技术出现了突破性的进展，Young和McCarty发明了厌氧滤池。与此同时，Zeikus等人提出了厌氧消化的四类群理论，更确切地阐明了复杂有机物厌氧消化的微生物过程。1979年，厌
氧技术出现了重大的突破，荷兰农业大学环培系Leftinga 等研制成功了式厌氧污泥床.
这些新工艺使可溶性原料在池内发酵时间大大缩短，使沼气发酵技术得到广泛的推广。